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Sequenciamento de DNA ajuda a estudar cianobactérias
A proliferação de cianobactérias é um grande problema ambiental em todo o mundo. Elas podem ter impactos diretos na segurança do abastecimento de água potável, produzindo uma variedade de toxinas que também representam riscos à saúde para nadadores e velejadores. Embora muitos possam associar cianobactérias com algas verdes brilhantes vistas na superfície dos lagos, Ellen Cameron, estudante de doutorado no Departamento de Biologia da Universidade de Waterloo, no Canadá, está usando o sequenciamento de DNA para estudar comunidades de cianobactérias em lagos com poucos nutrientes no norte de Ontário.
“Mesmo que os lagos em que estou trabalhando pareçam lagos pitorescos estereotipados de Ontário, eles têm grande abundância de cianobactérias. Estamos tentando entender melhor as comunidades de cianobactérias que estão nesses lagos usando o sequenciamento de DNA para procurar marcadores genéticos específicos que podem nos dizer sobre a identidade dos organismos e quais funções eles podem estar desempenhando”, explicou Ellen Cameron.
Cameron está trabalhando ao lado de pesquisadores no projeto forWater da professora Dra. Monica Emelko. Seus locais de pesquisa fazem parte de uma estação de pesquisa de longo prazo operada pelo Natural Resources Canada e pelo Environment and Climate Change Canada na Bacia Hidrográfica dos Lagos Turkey. Cameron e sua equipe descobriram que em alguns dos pontos de amostragem, as cianobactérias compunham 60% da comunidade microbiana total. Usando o sequenciamento metagenômico shotgun, uma técnica que sequencia todo o DNA presente na amostra, Cameron e sua equipe conseguiram recuperar três genomas de alta qualidade para cianobactérias selecionadas encontradas nos lagos que contêm a informação genética desses organismos. Essa descoberta ajudará a entender melhor as vias e funções desses organismos.
“A recuperação dos genomas de cianobactérias e a identificação de genes de toxinas fornecerão uma visão crítica para a compreensão das ameaças que as cianobactérias impõem em sistemas de baixo teor de nutrientes que podem não ter florações visíveis”, destacou Ellen Cameron.
Co-supervisionada pela Dra. Kirsten Müller, professora do Departamento de Biologia da Universidade de Waterloo, e pela Dra. Monica Emelko, Presidente de Pesquisa do Canadá em Ciência, Tecnologia e Políticas da Água e professora do Departamento de Engenharia Civil e Ambiental da universidade, Cameron espera que sua pesquisa melhore as estruturas para o projeto de protocolos de amostragem ecologicamente significativos para o monitoramento de cianobactérias.
Ellen Cameron reconheceu os benefícios de trabalhar em equipes interdisciplinares enquanto trabalhava em problemas complexos de águas: “A co-supervisão me permitiu obter o apoio de ambos os grupos de laboratório, o que foi uma experiência inestimável e ajudou a me fornecer insights sobre meus dados que, como uma bióloga sozinha, talvez eu não teria pensado ”, concluiu a pesquisadora.
Acesse a notícia completa na página da Universidade de Waterloo (em inglês).
Fonte: Allie Dusome, Water Institute/Universidade de Waterloo.
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